• Mühlhausen (Thüringen): Kreisstadt des Unstrut-Hainich-Kreises, Thüringen
• Mühlhausen (Kraichgau): Gemeinde im Rhein-Neckar-Kreis, Baden-Württemberg
• Mühlhausen (Franken): Gemeinde im Landkreis Erlangen-Höchstadt, Bayern
• Mühlhausen (Oberpfalz): Gemeinde im Landkreis Neumarkt in der Oberpfalz, Bayern
• Mühlhausen im Täle: Gemeinde im Landkreis Göppingen, Baden-Württemberg

Mülhausen

• Mülhausen (Mulhouse): Stadt im Departement Haut-Rhin, Frankreich.

Stadt- und Ortsteile mit dem Namen Mühlhausen

• Mühlhausen: Stadtbezirk von Stuttgart in Baden-Württemberg
• Mühlhausen, Vogtland: Stadtteil der Stadt Bad Elster im Vogtlandkreis, Sachsen
• Mühlhausen, Schwaben: Ortsteil der Gemeinde Affing im Landkreis Aichach-Friedberg, Bayern
• Mühlhausen bei Biberach: Ortsteil der Gemeinde Eberhardzell im Landkreis Biberach, Baden-Württemberg
• Mühlhausen bei Ingolstadt: Stadtteil der Stadt Ingolstadt, Bayern
• Mühlhausen an der Enz: Stadtteil der Stadt Mühlacker im Enzkreis, Baden-Württemberg
• Mühlhausen bei Ergoldsbach: Ortsteil der Gemeinde Mengkofen im Landkreis Dingolfing-Landau, Bayern
• Mühlhausen bei Homberg: Stadtteil der Stadt Homberg (Efze) im Schwalm-Eder-Kreis, Hessen
• Mühlhausen, Niederbayern: Stadtteil der Stadt Neustadt an der Donau im Landkreis Kelheim, Bayern
• Mühlhausen bei Würzburg: Ortsteil der Gemeinde Estenfeld im Landkreis Würzburg, Bayern
• Mühlhausen bei Schweinfurt: Ortsteil der Gemeinde Werneck im Landkreis Schweinfurt, Bayern
• Mühlhausen bei Schwenningen: Stadtteil der Stadt Villingen-Schwenningen im Schwarzwald-Baar-Kreis, Baden-Württemberg
• Mühlhausen bei Unna: Stadtteil der Kreisstadt Unna, Nordrhein-Westfalen
• Mühlhausen, Waldeck: Ortsteil der Gemeinde Twistetal im Landkreis Waldeck-Frankenberg, Hessen
• Mühlhausen im Oberbergischen Kreis ist eine von 51 Ortschaften der Stadt Wiehl in NRW, siehe Mühlhausen (Wiehl)
• Mühlhausen an der Würm: Ortsteil der Gemeinde Tiefenbronn im Enzkreis, Baden-Württemberg
• Mühlhausen bei Engen: Ortsteil der Gemeinde Mühlhausen-Ehingen im Landkreis Konstanz, Baden-Württemberg